有。会缩短手机的使用寿命，可能会损坏电池，可能会无法充电，降低安全性等。
一、会缩短手机的使用寿命，充电器上都有标称的输出电压和电流，如果购买的充电器是正规厂家的，电压和电流标称和实际一致的话，给手机充电不会有影响，如非原装充电线充电会造成手机电池供电不稳定，导致自动关机，自动重启，打电话自动关机等。
二、可能会损坏电池，苹果手机充电器输出，大部分都是5v和1a，5v代表的是充电器能够输出稳定的直流电压，1a是指输出的的电流，如果使用的非原装的充电器，电流输出过大或者过小，都容易损坏电池电极，导致电池鼓包膨胀，影响电池寿命等。
三、可能会无法充电，ios7系统之后，苹果手机就开启了数据线认证标准，部分非原装充电器可能会导致手机不能充电，需要更换。
四、降低安全性，原装充电器充满了会自动断电，非原装充电器会放电流，然后再充再放，不安全，因此建议坚持使用原装充电器。