化肥主要指尿素、硫酸铵、硝酸铵、碳酸铵等，个别商贩为了催芽，缩短生长期，使豆芽粗壮，在生产中施放化肥。豆芽中的化肥大部分被豆芽吸收，这种豆芽不仅口感差，无脆嫩鲜美味道，还会对胃产生刺激。更重要的是，化肥都是含铵类化合物，在细菌的作用下，可以转变成亚硝胺，亚硝胺是一种强致癌物质，所以人吃了用化肥浸泡过的豆芽菜，必然会伤害身体。
鉴别化肥浸泡过的豆芽菜：
(1)看豆芽秆，自然培育的豆芽菜是芽身挺直稍细，芽脚不软、脆嫩、光泽白，而用化肥浸泡过的豆芽菜，芽秆粗壮发水，色泽灰白。
(2)看豆芽根，自然培育的豆芽菜，根须发育良好，无烂根、烂尖现象，而用化肥浸泡过的豆芽菜，根短、少根或无根。
(3)看豆粒，自然培育的豆芽，豆粒正常，而用化肥浸泡过的豆芽、豆粒发蓝。
(4)看折断豆芽秆的断面是否有水分冒出，无水分冒出的是自然培育的豆芽，有水分冒出的是用化肥浸泡过的豆芽。
鉴别化肥浸泡过的豆芽菜：
(1)看豆芽秆，自然培育的豆芽菜是芽身挺直稍细，芽脚不软、脆嫩、光泽白，而用化肥浸泡过的豆芽菜，芽秆粗壮发水，色泽灰白。
(2)看豆芽根，自然培育的豆芽菜，根须发育良好，无烂根、烂尖现象，而用化肥浸泡过的豆芽菜，根短、少根或无根。
(3)看豆粒，自然培育的豆芽，豆粒正常，而用化肥浸泡过的豆芽、豆粒发蓝。
(4)看折断豆芽秆的断面是否有水分冒出，无水分冒出的是自然培育的豆芽，有水分冒出的是用化肥浸泡过的豆芽。