鱼会积累毒素，例如汞、二恶英和多氯联苯 (pcb)。此外，变质的鱼油可能会产生过氧化物。
虽然一份鱼可能含有十亿分之 10 到 1,000 的汞，但鱼油补充剂并未被发现含有相似的汞含量，因为它们通常是经过纯化的。
研究表明，未纯化的鱼油补充剂含有不安全水平的环境污染物，但 80% 的鱼油补充剂公司证实它们已达到美国最严格的污染物消除标准。
使用鱼油补充剂时，最好的 omega-3 鱼油含有虾青素（一种强大的抗氧化剂，也有助于稳定鱼油），首选是由野生太平洋鲑鱼制成的鱼油，它含有高水平的 dha /epa 和虾青素。藻油产品或补充剂对于遵循素食或希望采用更可持续选择的人来说也是不错的选择。
藻油是直接从藻类中提取的油。它含有 dha，占大脑中 97% 的 omega-3 脂肪。
不幸的是，没有足够多的美国人获得足够的这种必需脂肪酸来源。藻油是一种植物性海洋dha油，并非来自冷水鱼。
随着科学家和医生意识到omega-3 脂肪酸对美国人的重要性，他们开始研究从鱼类以外的来源获取这些必需脂肪酸的其他方法。
冷水、多脂肪的鱼，如鲑鱼，也是这些健康脂肪的良好饮食来源，但除了鲑鱼，没有太多方法可以定期将这种营养物质纳入饮食。海藻油提供 dha，因为它不是来自鱼类，所以它是可持续的，可作为植物性素食选择。
使用海藻油也没有海洋污染物的风险。