由于跨国公司具有强大的经济实力，且根据其全球战略在世界范围内追求高额利润，这就会在跨国公司与东道国间、跨国公司与母国间、东道国与母国间产生种种矛盾和冲突，其中，以跨国公司与东道国的冲突最为引人注目。1.跨国公司对东道国国家主权的挑战。a.跨国公司利用各种手段无视东道国的法律，逃避东道国法律管制。b.破坏东道国国家国民发展计划，逐渐控制东道国经济命脉。c.垄断东道国市场，掠夺性地开采使用东道国的自然资源。2.采用转移定价、不合理分摊成本和费用等手段来逃避东道国税收或外汇管制。转移定价是指跨国公司的跨国联属企业彼此在进行交易时不按照一般市场价格标准，而是根据逃避有关国家或地区税收的目的需要，人为地提高或降低关联企业的交易价格，使利润从税负较高的国家转移到税负较低的国家，从而达到整个公司群体减少纳税目的的一种跨国或跨地区避税行为。这也是我国外商投资企业经常采用的一种避税行为，是我国外商投资企业虚亏实盈的最重要原因之一。不合理分摊成本和费用是指跨国公司内部母公司通过不合理分摊成本和费用的方式，人为增加某一个或者某几个子公司的成本费用，从而减少该子公司赢利的数额，来达到逃避该子公司所在国税收的目的。3.与东道国的发展目标和计划相冲突。跨国公司及其分支机构特别是跨国独立子公司，在安排其境外的生产经营时往往根据被投资国家的投资环境及母公司的全球战略来安排公司的投资、经营，可能引发东道国经济发展不平衡。如区域经济发展不平衡、产业经济发展不平衡、个人经济报酬不平衡。4.在技术转让方面，跨国公司为了垄断技术，往往采取各种限制性条款，阻碍技术交流和东道国技术的发展，抬高技术转让费用，谋取暴利。5.在雇佣与劳动问题上，一方面不愿意雇佣东道国的技术和管理人员，另一方面不重视劳动安全保护问题，不执行东道国社会保障法律制度。6.在资金流动和东道国国际收支问题上，跨国公司为逃避汇兑风险或进行货币投机等目的，大量转移资金，往往会给东道国的国际收支造成负面影响。7.在环境保护上与东道国产生矛盾，开设严重污染企业给东道国带来损害。8.在思想文化上，也可能带来各种腐朽的思想文化腐蚀东道国的人民，特别是青少年一代，进而危害东道国国家利益。如“拜金主义”、“性解放”等腐朽思想观念。9.在消费者保护问题上，跨国公司可能不注意产品对消费者健康的损害和安全问题，从而对消费者造成损害。
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