先天性心脏病原因是多方面的，目前认为先天性心脏病原因有关的因素主要有下列五类：
先天性心脏病原因一：胎儿发育环境的因素
子宫内病毒感染是最重要的先天性心脏病原因，其中又以风疹病毒感染最为突出，其次为柯萨奇病毒感染。母亲如在妊娠前三个月内患风疹，则所产婴儿的先天性心脏病患病率较高；其中以动脉导管未闭和肺动脉瓣口狭窄为多。这是由于胎儿心脏大血管的发育在妊娠第二至八周中形成，而此时子宫内病毒感染足以影响到胎儿心脏发育之故。
其他如羊膜的病变、胎儿受压、妊娠早期先兆流产，母体营养不良、糖尿病、苯酮尿、高血钙、放射线和细胞毒性药物在妊娠早期的应用等，都是使胎儿发生先天性心脏病的原因。
母亲在怀孕期间吃了某些药物，也可以导致胎儿心脏畸形。
先天性心脏病原因二：早产
早产是重要的先天性心脏病原因。早产儿患室缺和动脉导管未闭者较多，前者与心室间隔在出生前无足够时间完成发育有关，后者与早产儿的血管收缩反应在出生后还不够强有关。
出生时体重在2500g以下的新生儿尤易患先天性心脏病。
先天性心脏病原因三：高原环境
高原氧分压低是先天性心脏病原因之一。
高原地区先天性心脏病-动脉导管未闭和先天性心脏病房缺较多。我国青海高原本病患病率远较平原地区高。
先天性心脏病原因四：遗传因素
遗传因素也是先天性心脏病原因之一。在一个家庭中，兄弟姊妹同时或父母子女同时患先天性心脏病，以及不少染色体异常的遗传病同时有心脏血管畸形的事例，说明本病有遗传因素存在。
遗传学的研究认为，多数的先天性心脏病是多个基因与环境因素相互作用所形成。
先天性心脏病原因五：其它因素
高龄也是先天性心脏的原因之一。高龄的母亲(35岁以上)产患法洛四联症、唐氏综合症婴儿的危险性较大。
有些先天性心脏病有显著的男女性别间发病差异。
先天性心脏病的症状。
先天性心脏病有以下常见症状，但轻症先天性性心脏病可无明显症状。家长如果发现自己的孩子有下述症状，应及早到医院就诊，以确诊是否患有先天性心脏病。
青紫：青紫是青紫型先天性心脏病（如大血管错位，法乐氏四联症等）的突出表现。可于出生后持续存在，也可于出生后三至四个月逐渐明显，在口唇、指（趾）甲床、鼻尖最明显。而潜伏青紫型心脏病（如室间隔缺损、房间隔缺损、动脉导管未闭）平时并无青紫，只是在活动、哭闹、屏气或患肺炎时才出现青紫，晚期发生肺动脉高压和右心衰竭时可出现持续青紫。
心脏杂音：多数先天性心脏病都可听到杂音，这种杂音比较响亮，粗糙，严重者可伴有胸前区震颤。心脏杂音多在就诊时被医生发现。部分正常儿童可有生理性杂音。
体力差：由于心功能差、供血不足和缺氧所致，重症患儿在婴儿期即有喂养困难，吸吮数口就停歇，气促，易呕吐和大量出汗，喜竖抱，年长儿不愿活动，喜蹲踞，活动后易疲劳，阵发性呼吸困难，缺氧严重者常在哺乳、哭闹或大便时突然昏厥，易出现心衰。
易患呼吸道感染：多数先天性心脏病由于肺血增多，平时易反复患呼吸道感染，反复呼吸道感染又进一步导致心功能衰竭，二者常常互为因果，成为先天性心脏病的死亡原因。
发育差：先天性心脏病多有发育迟缓，有青紫者尤其明显，严重者智力发育也可能受影响。
其它症状：先天性心脏病如有左心房扩大或肺动脉压迫喉返神经，则自幼哭声嘶哑、易气促、咳嗽；合并其它畸形，如先天性白内障、唇腭裂和先天愚型等；心室增大可致心前区隆起，胸廓畸形；持续青紫者可伴有杵状指，多在青紫出现后1～2年形成。
关于先天性心脏病遗传
先天性心脏病的病因学目前尚不完全清楚。但随着目前分子生物学的发展，人们发现遗传因素在先天性心脏病的发生发展中起一定作用。比如marfan 综合征其为一常染色显性遗传疾病，其基因定位已十分明确，位于15号染色体的长臂上，迄今已发现了20多个突变位点。
先心病与遗传一定关系，研究证实，先心病具有遗传倾向，若母亲患有先心病，则孩子患病几率比正常人高；若第一胎患有先心病，则第二胎患病几率也会增加。
先心病中5%伴有染色体异常，3%伴有单基因突变。另外，先心病的遗传，多与某些遗传性疾病有关。因此，目前认为，多数先心病是多个基因与环境因素互相作用所形成的。
先天性心脏病原因一：胎儿发育环境的因素
子宫内病毒感染是最重要的先天性心脏病原因，其中又以风疹病毒感染最为突出，其次为柯萨奇病毒感染。母亲如在妊娠前三个月内患风疹，则所产婴儿的先天性心脏病患病率较高；其中以动脉导管未闭和肺动脉瓣口狭窄为多。这是由于胎儿心脏大血管的发育在妊娠第二至八周中形成，而此时子宫内病毒感染足以影响到胎儿心脏发育之故。
其他如羊膜的病变、胎儿受压、妊娠早期先兆流产，母体营养不良、糖尿病、苯酮尿、高血钙、放射线和细胞毒性药物在妊娠早期的应用等，都是使胎儿发生先天性心脏病的原因。
母亲在怀孕期间吃了某些药物，也可以导致胎儿心脏畸形。
先天性心脏病原因二：早产
早产是重要的先天性心脏病原因。早产儿患室缺和动脉导管未闭者较多，前者与心室间隔在出生前无足够时间完成发育有关，后者与早产儿的血管收缩反应在出生后还不够强有关。
出生时体重在2500g以下的新生儿尤易患先天性心脏病。
先天性心脏病原因三：高原环境
高原氧分压低是先天性心脏病原因之一。
高原地区先天性心脏病-动脉导管未闭和先天性心脏病房缺较多。我国青海高原本病患病率远较平原地区高。
先天性心脏病原因四：遗传因素
遗传因素也是先天性心脏病原因之一。在一个家庭中，兄弟姊妹同时或父母子女同时患先天性心脏病，以及不少染色体异常的遗传病同时有心脏血管畸形的事例，说明本病有遗传因素存在。
遗传学的研究认为，多数的先天性心脏病是多个基因与环境因素相互作用所形成。
先天性心脏病原因五：其它因素
高龄也是先天性心脏的原因之一。高龄的母亲(35岁以上)产患法洛四联症、唐氏综合症婴儿的危险性较大。
有些先天性心脏病有显著的男女性别间发病差异。
先天性心脏病的症状。
先天性心脏病有以下常见症状，但轻症先天性性心脏病可无明显症状。家长如果发现自己的孩子有下述症状，应及早到医院就诊，以确诊是否患有先天性心脏病。
青紫：青紫是青紫型先天性心脏病（如大血管错位，法乐氏四联症等）的突出表现。可于出生后持续存在，也可于出生后三至四个月逐渐明显，在口唇、指（趾）甲床、鼻尖最明显。而潜伏青紫型心脏病（如室间隔缺损、房间隔缺损、动脉导管未闭）平时并无青紫，只是在活动、哭闹、屏气或患肺炎时才出现青紫，晚期发生肺动脉高压和右心衰竭时可出现持续青紫。
心脏杂音：多数先天性心脏病都可听到杂音，这种杂音比较响亮，粗糙，严重者可伴有胸前区震颤。心脏杂音多在就诊时被医生发现。部分正常儿童可有生理性杂音。
体力差：由于心功能差、供血不足和缺氧所致，重症患儿在婴儿期即有喂养困难，吸吮数口就停歇，气促，易呕吐和大量出汗，喜竖抱，年长儿不愿活动，喜蹲踞，活动后易疲劳，阵发性呼吸困难，缺氧严重者常在哺乳、哭闹或大便时突然昏厥，易出现心衰。
易患呼吸道感染：多数先天性心脏病由于肺血增多，平时易反复患呼吸道感染，反复呼吸道感染又进一步导致心功能衰竭，二者常常互为因果，成为先天性心脏病的死亡原因。
发育差：先天性心脏病多有发育迟缓，有青紫者尤其明显，严重者智力发育也可能受影响。
其它症状：先天性心脏病如有左心房扩大或肺动脉压迫喉返神经，则自幼哭声嘶哑、易气促、咳嗽；合并其它畸形，如先天性白内障、唇腭裂和先天愚型等；心室增大可致心前区隆起，胸廓畸形；持续青紫者可伴有杵状指，多在青紫出现后1～2年形成。
关于先天性心脏病遗传
先天性心脏病的病因学目前尚不完全清楚。但随着目前分子生物学的发展，人们发现遗传因素在先天性心脏病的发生发展中起一定作用。比如marfan 综合征其为一常染色显性遗传疾病，其基因定位已十分明确，位于15号染色体的长臂上，迄今已发现了20多个突变位点。
先心病与遗传一定关系，研究证实，先心病具有遗传倾向，若母亲患有先心病，则孩子患病几率比正常人高；若第一胎患有先心病，则第二胎患病几率也会增加。
先心病中5%伴有染色体异常，3%伴有单基因突变。另外，先心病的遗传，多与某些遗传性疾病有关。因此，目前认为，多数先心病是多个基因与环境因素互相作用所形成的。