地面堆码贮藏：选用没有直射光、空气流通，土质或红砖地面的空屋作贮藏室。堆放时，保持南瓜挨着地面的方向向下，瓜蒂朝里瓜顶向外码成圆锥形。保持室内空气新鲜、干燥和凉爽；冬季关闭门窗防寒。
架式分层贮藏：贮藏室内用竹木或角铁搭成分层贮藏架，每层贮藏架上铺5cm厚稻草或麦秸，将南瓜放置上架即可。
地窖低温贮藏：地上铺垫5cm厚的细沙或麦秸、稻草，堆放2∼3层瓜；也可搭架子将南瓜放在架子上。窖内温度控制在10℃左右，相对湿度保持70%∼80%。贮藏前要注意选好南瓜，适期采收，不能遭受霜打，瓜蒂处保留5cm长的瓜梗，防止机械损伤。贮藏中要注意勤检查，发现有病斑的瓜立即剔出以免感染好瓜。
浸蜡贮藏：除了把南瓜放在通风的地方，观赏性的南瓜如果能够放在液体蜡中浸一下，就可以保存一年左右基本没有问题。