概念不同、特点不同、净水技术不同、使用功能不同。
概念的区别：净水机是通过过滤和吸附的物理方式去除城市自来水中的氯气和细菌病毒、胶体、铁锈、杂质等各种对人体有害的有机污染。纯水机是通过有着超细精度的ro膜反渗透的方式截流住水中的一切有机污染物和无机离子，有一定的废水量，出水为直饮纯净水。
特点的区别 ：净水机多数是选择使用活性炭、熔喷虑芯、微孔陶瓷、中空纤维、kdf等来净化水的，这些材料是需要定期更换的，而滤芯也需要做好保护工作。净水机的净化效果不错，不过不能去除水中的钙镁离子，也就是水碱的问题不能解决。纯水机是去除细菌、病毒、胶体、铁锈、杂质等各种人体有害的有机污染的，能减少水垢出现。
净水技术的区别：纯水机是通过有着超细精度的ro膜反渗透的方式截流住水中的一切有机污染物和无机离子，有一定的废水量，出水为直饮的纯净水。净水机是通过过滤和吸附的物理方式去除城市自来水中的氯气和因二次污染所产生的细菌病毒、胶体、铁锈、杂质等各种对人体有害的有机污染物。
使用功能的区别：纯水机能过虑掉自来水中所有物质，包括矿物质，出来的水是纯水，纯水机以自来水作为水源，通过反渗透水处理技术净化出纯水。家用纯水机精致小巧一般安装于厨房，并配有一纯净水专用龙头，除了直接饮用喝，还能解决炒菜等用水问题，装纯水机并不影响饮水机的使用，因为纯水机自制的纯净水可通过饮水机加热或制冷。净水机能够过滤掉自来水氯、杂质等，保留了自来水中的对人体有用的矿物质；但是对重金属和水碱的作用不是很大，所以还是没有达到直接饮用的目的，最好还是烧开后在饮用。