高、中风险区的居民，健康码从国务院将该地区定为高、中风险区那天起，自动变成黄码或红码。风险区降级后，健康码的颜色也随之改变。如果成为密接或者病历，只要疫情信息依次通过信息系统报到赋码公司平台，平台便将其绿码转为红码。
健康码是以实际真实数据为基础，由市民或者返工返岗人员通过自行网上申报，经后台审核后，即可生成属于个人的二维码。该二维码作为个人在当地出入通行的一个电子凭证，实现一次申报，全市通用。健康码的推出，旨在让复工复产更加精准、科学、有序。2020年12月10日，国家卫健委、国家医保局、国家中医药管理局联合发布《关于深入推进“互联网＋医疗健康”“五个一”服务行动的通知》，明确要求各地落实“健康码”全国互认、一码通行。